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  • Prédiction de l’épitopes de la glycoprotéine Hémagglutinine- Neuraminidase (HN) du virus de la Maladie de Newcastle du génotype XI à Madagascar : Étude in silico
    Revue des ISTs de Madagasikara

    auteurs : Ravoavy. H ; Randriamamisolonirina. N. T ; Andriantsimahavandy. A. A. ;
    Maminiaina. O. F

    Mots clé : Maladie de Newcastle, NDV, Vaccin, Hémagglutinine-Neuraminidase, Épitopes, immuno-informatiques.

    [FRS] La maladie de Newcastle (MN) est l’une des maladies les plus graves chez les volailles domestiques et les oiseaux sauvages. Ainsi, elle reste la menace de pertes économiques considérables pour les élevages aviaires. La MN est causée par le virus de la maladie de Newcastle (NDV). Des vaccins classiques ont été disponibles pour le contrôle de l’effet dévastateur de cette maladie. Pourtant, des foyers de la MN ont toujours trouvés, même dans les troupeaux vaccinés. Afin d’améliorer la qualité des vaccins existants, cette étude vise à prédire tous les dérivés antigéniques présents dans la souche de NDV MG-725 et La Sota ; en utilisant des approches immuno-informatiques. Au total, deux glycoprotéines membranaires hémagglutinine neuraminidase (HN) de NDV extraites de la base de données NCBI protéines. Ensuite, la structure 3D de ces deux protéines a été modélisée à l’aide du serveur SwissModel et visualisée à l’aide du logiciel Discovery studio. Après, les séquences téléchargées et les structures modélisés ont été analysés par des outils de prédiction de la base de données d’épitopes immunitaires. 66 peptides antigéniques ont été prédits en tant qu’épitopes B tandis que neuf peptides ont été prédits entant qu’épitopes T. Parmi lesquelles, 37 épitopes B et 5 épitopes TCD4+ sont trouvés spécifiques des souches MG-725 et La Sota. Ainsi, ces épitopes pourraient être les dérivés antigéniques qui différentient ces deux souches. Il s’agit d’une étude préliminaire et nous recommandons ainsi une autre étude plus approfondie pour en valoriser.

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